Es poden presentar un ventall molt ampli de símptomes però també hi ha persones assimptomàtiques:

​

Símptomes digestius: Inflor de panxa, gasos, diarrea, estrenyiment, vòmits...

​

Símptomes extra digestius: Migranya, cefalea, boira mental, baix percentil de pes i talla, aftes bucals, problemes de l’esmalt dentari, anèmia ferropènica, osteoporosi, cansament extrem, problemes a la pell, infertilitat, avortaments de repetició, problemes articulars i musculars, tristesa, apatía, retard puberal, ansietat, irritabilitat...

​​​

La Dermatitis Herpetiforme és la manifestació de la celiaquia a la pell. Aquesta dermatitis brota en avantbraços, colzes, darrera els genolls, coxis i cuir cabellut tot i que es pot estendre a més zones del cos. Les ampolles piquen molt i es van assecant amb el pas dels dies. Un dermatòleg podrà diagnosticar-la mitjançant una biòpsia d’una de les lesions, sent una prova senzilla i molt poc dolorosa. Les persones amb DH son celíaques però no tots els celíacs pateixen la DH. Caldrà igualment confirmar el diagnòstic de celiaquia amb el metge digestiu.

​

Algunes patologies poden anar relacionades amb la malaltia celíaca com per exemple la síndrome de Sjögren (sequedat a les mucoses, ulls, boca...) síndrome de Down, diabetis tipus 1, fibromialgia, malaties de les tiroides, etc..)